Anna Meeuwisse disputerade 1997 med avhandlingen Vänskap och organisering. En studie av Fountain House-rörelsen (Arkiv förlag). Avhandlingen lade grunden för hennes forskningsintressen för sociala rörelser och civilsamhällets roll och funktion i välfärdsstaten. På senare tid har hennes forskning rört europeiseringen av det svenska civilsamhället, civilsamhällets elitisering och transnationella, konservativa rörelser som bekämpar sexuella och reproduktiva rättigheter. Hon har också intresserat sig för frågor om socialt arbete som kunskaps- och forskningsfält.